Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPSEQ9Y251 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPSEQ9Y251 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms