Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SHOC2Q9UQ13 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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