Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SORCS3Q9UPU3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORCS3Q9UPU3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms