Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSEQ9UL01 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DSEQ9UL01 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DSEQ9UL01 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DSEQ9UL01 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSEQ9UL01 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DSEQ9UL01 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSEQ9UL01 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSEQ9UL01 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSEQ9UL01 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSEQ9UL01 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DSEQ9UL01 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSEQ9UL01 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DSEQ9UL01 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSEQ9UL01 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSEQ9UL01 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DSEQ9UL01 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSEQ9UL01 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSEQ9UL01 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DSEQ9UL01 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSEQ9UL01 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSEQ9UL01 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DSEQ9UL01 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSEQ9UL01 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSEQ9UL01 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSEQ9UL01 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSEQ9UL01 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DSEQ9UL01 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DSEQ9UL01 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DSEQ9UL01 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSEQ9UL01 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DSEQ9UL01 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms