Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms