Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL13Q9P2N7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms