Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHPF2Q9P2E5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms