Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK13-1Q9NX77 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms