Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms