Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms