Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms