Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms