Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-5Q9HDB9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-5Q9HDB9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms