Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms