Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPAP3Q9H6T3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms