Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC8Q9H0W5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC8Q9H0W5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms