Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSG1Q9H089 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms