Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2OQ9C0C9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms