Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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