Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC2Q9BYS8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC2Q9BYS8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms