Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM14BQ9BX40 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM14BQ9BX40 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms