Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRACR2AQ9BSW2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms