Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQJ4

TMEM47, Transmembrane protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM47Q9BQJ4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM47Q9BQJ4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms