Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms