Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PIK3R4Q99570 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms