Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
IFT140Q96RY7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
IFT140Q96RY7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1281.7 ms