Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCCC1Q96RQ3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCCC1Q96RQ3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms