Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNDC3BQ96NL0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms