Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms