Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms