Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR3Q96KR7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms