Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC41A2Q96JW4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC41A2Q96JW4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms