Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms