Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC34Q96HJ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms