Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BORCS6Q96GS4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BORCS6Q96GS4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms