Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms