Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RUNDC1Q96C34 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUNDC1Q96C34 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms