Protein–RNA interactions for Protein: Q969H4

CNKSR1, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1Q969H4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNKSR1Q969H4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNKSR1Q969H4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms