Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPS3Q969F9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms