Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSR2Q969E8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms