Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GATAD2BQ8WXI9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms