Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms