Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC12Q8WUD4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms