Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL22A1Q8NFW1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL22A1Q8NFW1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL22A1Q8NFW1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL22A1Q8NFW1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL22A1Q8NFW1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL22A1Q8NFW1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
COL22A1Q8NFW1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL22A1Q8NFW1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL22A1Q8NFW1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL22A1Q8NFW1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COL22A1Q8NFW1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms