Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH4

NUP37, Nucleoporin Nup37, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP37Q8NFH4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP37Q8NFH4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms