Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF397Q8NF99 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms