Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms