Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms