Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00269Q8N2A0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00269Q8N2A0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00269Q8N2A0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00269Q8N2A0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00269Q8N2A0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms