Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLF2Q8IX21 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms